Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAMP50895 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAMP50895 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAMP50895 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAMP50895 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAMP50895 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAMP50895 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms