Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRE11P49959 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRE11P49959 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRE11P49959 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRE11P49959 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRE11P49959 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRE11P49959 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRE11P49959 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRE11P49959 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRE11P49959 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRE11P49959 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms