Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP153P49790 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP153P49790 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP153P49790 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP153P49790 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP153P49790 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP153P49790 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP153P49790 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP153P49790 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP153P49790 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP153P49790 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP153P49790 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP153P49790 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP153P49790 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP153P49790 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP153P49790 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP153P49790 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP153P49790 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP153P49790 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms