Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME1P48163 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ME1P48163 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ME1P48163 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms