Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSFMP43897 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSFMP43897 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSFMP43897 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSFMP43897 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSFMP43897 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSFMP43897 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms