Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-1P43699 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-1P43699 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-1P43699 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-1P43699 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-1P43699 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-1P43699 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-1P43699 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-1P43699 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-1P43699 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-1P43699 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-1P43699 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-1P43699 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-1P43699 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms