Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR4A2P43354 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR4A2P43354 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR4A2P43354 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR4A2P43354 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR4A2P43354 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR4A2P43354 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR4A2P43354 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR4A2P43354 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR4A2P43354 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR4A2P43354 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR4A2P43354 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR4A2P43354 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms