Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD52P43351 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD52P43351 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD52P43351 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD52P43351 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD52P43351 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD52P43351 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD52P43351 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD52P43351 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD52P43351 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD52P43351 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD52P43351 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD52P43351 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD52P43351 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD52P43351 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD52P43351 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD52P43351 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD52P43351 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms