Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRATP43155 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRATP43155 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRATP43155 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms