Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms