Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBRP36941 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBRP36941 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms