Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms