Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms