Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB3P28472 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB3P28472 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB3P28472 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB3P28472 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms