Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD1P28340 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLD1P28340 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD1P28340 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD1P28340 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms