Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms