Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4AP27815 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms