Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO1P25800 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO1P25800 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO1P25800 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO1P25800 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO1P25800 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms