Protein–RNA interactions for Protein: P24158

PRTN3, Myeloblastin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTN3P24158 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTN3P24158 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTN3P24158 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRTN3P24158 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PRTN3P24158 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRTN3P24158 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PRTN3P24158 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRTN3P24158 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRTN3P24158 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRTN3P24158 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRTN3P24158 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRTN3P24158 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRTN3P24158 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRTN3P24158 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRTN3P24158 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRTN3P24158 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRTN3P24158 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRTN3P24158 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRTN3P24158 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRTN3P24158 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRTN3P24158 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRTN3P24158 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRTN3P24158 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms