Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms