Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms