Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PVALBP20472 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PVALBP20472 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PVALBP20472 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PVALBP20472 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PVALBP20472 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PVALBP20472 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PVALBP20472 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PVALBP20472 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PVALBP20472 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PVALBP20472 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PVALBP20472 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PVALBP20472 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PVALBP20472 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PVALBP20472 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms