Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSP20132 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSP20132 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSP20132 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms