Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms