Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms