Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRF1P14222 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRF1P14222 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRF1P14222 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRF1P14222 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PRF1P14222 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRF1P14222 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRF1P14222 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms