Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms