Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms