Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms