Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3P10147 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3P10147 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms