Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms