Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC166P0CW27 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms