Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA6AP0CW24 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNMA6AP0CW24 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNMA6AP0CW24 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNMA6AP0CW24 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA6AP0CW24 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA6AP0CW24 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA6AP0CW24 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA6AP0CW24 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms