Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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