Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
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