Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms