Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFMP07197 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFMP07197 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFMP07197 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFMP07197 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms