Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRB1P04280 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRB1P04280 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms