Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THY1P04216 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THY1P04216 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THY1P04216 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
THY1P04216 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms