Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTNP04004 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTNP04004 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTNP04004 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTNP04004 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTNP04004 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTNP04004 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTNP04004 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTNP04004 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTNP04004 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTNP04004 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTNP04004 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms