Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OPN1SWP03999 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms