Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTA1P02549 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms