Protein–RNA interactions for Protein: P01717

IGLV3-25, Immunoglobulin lambda variable 3-25, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-25P01717 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IGLV3-25P01717 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGLV3-25P01717 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.8 ms