Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP19O94966 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP19O94966 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP19O94966 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP19O94966 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP19O94966 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP19O94966 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP19O94966 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP19O94966 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP19O94966 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP19O94966 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP19O94966 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP19O94966 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP19O94966 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP19O94966 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP19O94966 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP19O94966 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms