Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNKO75909 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNKO75909 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNKO75909 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNKO75909 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms