Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KALRNO60229 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KALRNO60229 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KALRNO60229 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KALRNO60229 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KALRNO60229 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KALRNO60229 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KALRNO60229 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KALRNO60229 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KALRNO60229 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms