Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms