Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
STX6O43752 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX6O43752 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX6O43752 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX6O43752 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX6O43752 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX6O43752 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX6O43752 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX6O43752 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX6O43752 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms