Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTIFO43310 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTIFO43310 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTIFO43310 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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