Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF1O43189 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms